ggplot2

ggplot2

ggplot2

ggplot2 es un paquete con un gran conjunto de funciones con el fin de realizar gráficos. Solo admite datos del tipo data.frames

La forma en que se creó la librería es por medio de “capas”, cada capa contiene una finalidad específica y el gráfico que queremos es la suma de todas las capas. Esta librería es particular en cuanto a que las capas se agregan con el signo +. El + puede ir antes de la siguiente capa en la misma línea de código o al final de la línea de código cuando queremos agregar la siguiente cada en el siguiente renglón. No se puede empezar una línea de código con el +.

Las capas que más se usan son:

  • Data: Se indican cuál son los datos. Con esta capa no se logra ningún gráfico porque no se ha especificado lo que se quiere graficar. Esta primera capa es ggplot(data)

  • Aesthetics: Es la Estética del gráfico como color, tipos de puntos, tipos de líneas, etc. Esta capa se agrega con + aes(). Con sola esta capa y la anterior (Data) no se puede graficas porque no se ha especificado el tipo de gráfico que se desea, para eso está la siguiente capa.

  • Geometries: En esta capa se indica qué se quiere hacer con Data y la Estética. Tiene muchos tipos de gráficos como de líneas, puntos, densidad, histogramas, mapas, etc. Esta capa se agrega con + geo_nombreFunción()

  • Facets: Divide el plot en subplots. + facet_grid() o con + facet_wrap()

  • Statistics: Al mismo tiempo que se hace un gráfico se pueden mostrar algunos cálculos estadísticos.

  • Coordinates: Se pueden invertir los ejes del gráfico con coord_flip

Código en R:

Instalar la librería: install.packages("tidyverse")

Alternativa: install.packages("ggplot2")

library(ggplot2)

Opcional: se puede inspeccionar la versión de la librería con packageVersion()

packageVersion("ggplot2")
[1] '3.3.0'

Importar datos:

datos = read.csv("Datos.csv", sep = ";", dec = ",", header = T)
print(datos)
   Nombre Edad Género  Peso Estrato
1  Ángela   22      F  62.5       3
2    José   10      M  75.8       4
3   Juan    15      M  54.4       3
4 Manuela   35      F  73.6       3
5 Maribel   50      F  70.0       5
6 Antonio   45      M 180.0       4
7  Alicia    1      F  15.7       1
8    Luis   32      M 103.5       5
str(datos)
'data.frame':       8 obs. of  5 variables:
 $ Nombre : Factor w/ 8 levels "Alicia","Ángela",..: 2 4 5 7 8 3 1 6
 $ Edad   : int  22 10 15 35 50 45 1 32
 $ Género : Factor w/ 2 levels "F","M": 1 2 2 1 1 2 1 2
 $ Peso   : num  62.5 75.8 54.4 73.6 70 ...
 $ Estrato: int  3 4 3 3 5 4 1 5

Data:

Con la capa de data solo se están cargando los datos a la librería ggplot2. Con solo esta capa no se logra graficar, por esta razón, si se corre el código no se hace un gráfico.

ggplot(data = datos)
../../_images/output_13_05.png

Es común en esta librería crear un objeto p que almacene todas las capas anteriores y que permita agregar más capas con el signo +

p <- ggplot(data = datos)
p
../../_images/output_15_04.png

Aesthetics:

Las principales estéticas de la capa aes() son:

  • x: para indicar el nombre de la columna para el eje \(X\).

  • y: para indicar el nombre de la columna para el eje \(y\).

  • colour: color.

  • size: tamaño.

  • shape: formas de los puntos o líneas.

  • alpha: para trasparencias. Se usa cuando se superpone varios tipos de gráfico. Entre más cercano a uno, más opaco el gráfico y entre más cercano a cero, más transparente.

  • fill: color de relleno.

shape:

shape

shape

ggplot(data = datos) + aes(X = Edad, y = Peso)
../../_images/output_18_05.png

Es común ver que la capa aes() es agregada dentro de la función inicial ggplot(data, aes()) o dentro de la capa Geometries geo_nombreFuncion(mapping = aes())

p <- ggplot(data = datos) + aes(x = Edad, y = Peso)
p
../../_images/output_20_04.png

Geometries:

Al agregar esta capa sí se muestra un gráfico porque se está indicando qué debe graficar con los datos ingresados y las estéticas definidas.

Algunos gráficos son:

Gráficos de dos variables:

geom_point()

geom_line()

geom_area()

geom_quantile()

geom_smooth()

Gráficos de una variable:

geom_histogram()

geom_freqpoly()

geom_density()

geom_area()

geom_bar()

geom_qq()

geom_col()

geom_boxplot()

geom_violin()

Gráficos de dos variables:

p <- ggplot(data = datos) + aes(x = Edad, y = Peso)
p + geom_point()
../../_images/output_25_03.png
p + geom_line()
../../_images/output_26_04.png
p + geom_area()
../../_images/output_27_02.png

Gráficos de una variable:

p <- ggplot(data = datos) + aes(x = Estrato)
p + geom_histogram()
stat_bin() using bins = 30. Pick better value with binwidth.
../../_images/output_30_1.png
p + geom_freqpoly()
stat_bin() using bins = 30. Pick better value with binwidth.
../../_images/output_31_14.png
p + geom_density()
../../_images/output_32_08.png
p + geom_boxplot()
../../_images/output_33_03.png
p + geom_bar()
../../_images/output_34_04.png

Para cambiar la orientación se hace en aes() indicando solo y

ggplot(data = datos) + aes(y = Estrato) +
    geom_bar()
../../_images/output_36_05.png

Cambiando Aesthetics:

Los datos en aes() se pueden agregar en cada capa en lugar de incluirlos al principio por separado así:

geo_nombreFunción(aes())

Tamaño de los puntos y líneas:

Con size se pueden cambiar el tamaño de todos los puntos y líneas al mismo tiempo si se agrega este argumento por fuera de la función aes()

ggplot(data = datos) +
    geom_point(aes(x = Edad, y = Peso), size = 10)
../../_images/output_41_04.png

Si se agrega la función sizepor dentro de aes() se pueden hacer una clasificación de los datos en función de una variable. Esta clasificación se hace cambiando el tamaño de los puntos.

size = variable - Variable para clasificar los datos.

ggplot(data = datos) +
    geom_point(aes(x = Edad, y = Peso, size = Estrato))
../../_images/output_43_04.png
ggplot(data = datos) +
    geom_line(aes(x = Edad, y = Peso, size = Estrato))
../../_images/output_44_02.png

Color:

Con color, colour o col se agregan colores clasificando los datos en una variable si este argumento se pone dentro de la función aes(). Por ejemplo, los datos de Edad y Peso serán clasificados por Género y cada Género tendrá un color diferente.

Si el color va por fuera de aes(), los datos no se clasifican, solo cambian de color todos los puntos o líneas.

ggplot(data = datos) +
    aes(x = Edad, y = Peso, color = Género) +
    geom_point(size = 5)
../../_images/output_47_03.png
ggplot(data = datos) +
    aes(x = Edad, y = Peso, color = Nombre)  +
    geom_point(size = 5)
../../_images/output_48_0.png
ggplot(data = datos) +
    geom_line(aes(x = Edad, y = Peso, color = Estrato))
../../_images/output_49_0.png
ggplot(data = datos) +
    geom_bar(aes(x = Estrato, color = Género))
../../_images/output_50_02.png
ggplot(data = datos) +
    geom_bar(aes(x = Estrato, fill = Género))
../../_images/output_51_03.png

Note que aparecen unos colores por defecto, pero podemos crear nuestra propia paleta de colores e ingresarlos manualmente.

Cuando clasificamos los datos por colores podemos cambiar los colores que la librería muestra por defecto.

Primero, se crea una variable con los colores: colores <- c("darkgreen", "darkblue").

Luego, se agregan en el gráfico como una capa adicional así: + scale_color_manual(values = colores)

colores <- c("darkgreen", "darkblue")
ggplot(data = datos) +
    aes(x = Edad, y = Peso, color = Género) +
    geom_point(size = 5) +
    scale_color_manual(values = colores)
../../_images/output_54_03.png

Tipos Líneas:

Se usa el argumento linetype igual a un número y por fuera de aes()

ggplot(data = datos) +
    geom_line(aes(x = Edad, y = Peso), linetype = 2, size = 1)
../../_images/output_56_02.png
ggplot(data = datos) +
    geom_line(aes(x = Edad, y = Peso), linetype = 10, size = 2)
../../_images/output_57_05.png

Forma de los puntos:

Con shape se pueden cambiar todos los puntos al mismo tiempo si se agrega este argumento por fuera de la función aes()

ggplot(data = datos) +
    geom_point(aes(x = Edad, y = Peso), shape = 10, size = 10)
../../_images/output_60_02.png

Si se agrega la función shapepor dentro de aes() se pueden hacer una clasificación de los datos en función de una variable cambiando la forma de los puntos o líneas.

shape = variable - Se pone la variable para clasificar los datos.

ggplot(data = datos) +
    geom_point(aes(x = Edad, y = Peso, shape = Género), size = 5)
../../_images/output_62_02.png

Transparencias:

alpha - Entre más cercano a uno, más opaco el gráfico y entre más cercano a cero, más transparente.

El siguiente ejemplo tiene dos gráficos superpuestos, con los valores que se dan en alpha se puede visualizar el gráfico del atrás.

ggplot(data = datos) +
    geom_histogram(aes(x = Peso),
                   color = "black",   # Color del borde.
                   fill = "darkred",  # Color del rectángulo.
                   bins = 10,
                   alpha = 0.6) +     # Transparencia de 0,6.
    geom_histogram(aes(x = Edad),
                   color = "black",
                   fill = "darkblue",
                   bins = 10,
                   alpha = 0.3)       # Transparencia de 0,3. Más transparente que el anterior.
../../_images/output_65_01.png
ggplot(data = datos) +
    geom_density(aes(x = Peso),
                   color = "darkred",   # Color del borde.
                   fill = "darkred",  # Color del rectángulo.
                   alpha = 0.5) +     # Transparencia de 0,6.
    geom_density(aes(x = Edad),
                   color = "darkblue",
                   fill = "darkblue",
                   alpha = 0.5)       # Transparencia de 0,3. Más transparente que el anterior.
../../_images/output_66_01.png

Facets:

Para crear subplots clasificando los datos.

``facet_wrap()``:

Para clasificar en función de variables discretas. Se crean varios gráficos para clasificar los datos.

facet_wrap(~ nombre variable)

ggplot(data = datos) +
    geom_point(aes(x = Edad, y = Peso), size = 5) +
    facet_wrap(~ Género)   # Divide el gráfico en función del Género
../../_images/output_71_02.png
ggplot(data = datos) +
    geom_point(aes(x = Edad, y = Peso), size = 5) +
    facet_wrap(~ Género, nrow = 2) # nrow = para cantidad de filas
../../_images/output_72_03.png
ggplot(data = datos) +
    geom_point(aes(x = Edad, y = Peso), size = 5) +
    facet_wrap(~ Estrato) # Divide el gráfico en función del Estrato
../../_images/output_73_01.png
ggplot(data = datos) +
    geom_point(aes(x = Edad, y = Peso), size = 5) +
    facet_wrap(~ Estrato, ncol = 4) # ncol = para cantidad de columnas
../../_images/output_74_01.png

En el siguiente gráfico se usa facet_wrap() para clasificar los datos por Estrato en cada subplot y al mismo tiempo se clasifican por Género al cambiar el color agregando color = Género dentro de aes()

ggplot(data = datos) +
    geom_point(aes(x = Edad, y = Peso, color = Género), size = 5) +
    facet_wrap(~ Estrato, ncol = 4) # ncol = para cantidad de columnas
../../_images/output_76_0.png

``facet_grid()``:

Crea subplots para clasificar los datos en una o dos variables.

facet_grid(nombre variable 1 ~ nombre variable 2)

facet_grid(y ~ X)

  • nombre variable 1: clasificación vertical.

  • nombre variable 2: clasificación horizontal.

Con dos variables:

ggplot(data = datos) +
    geom_point(aes(x = Edad, y = Peso), size = 5) +
    facet_grid(Género ~ Estrato) # Género (y) - vertical y Estrato (X) - horizontal.
../../_images/output_82_0.png

Con una sola variable:

Para omitir una variable se reemplaza por un punto .

ggplot(data = datos) +
    geom_point(aes(x = Edad, y = Peso), size = 5) +
    facet_grid(Género ~ .)
../../_images/output_85_0.png
ggplot(data = datos) +
    geom_point(aes(x = Edad, y = Peso), size = 5) +
    facet_grid(. ~ Género) # Cambia la posición al cambiar la variable
../../_images/output_86_01.png

Combinar gráficos:

ggplot(data = datos) +
    geom_point(aes(x = Estrato, y = Peso),
               size = 7,
               shape = 25,
               fill = "darkgray") +
    geom_line(aes(x = Estrato, y = Edad),
              linetype = 5,
              color = "darkred",
              lwd = 2)
../../_images/output_88_01.png

Statistics:

Con la librería ggplot2 se pueden hacer cálculos estadísticos y representarlos gráficamente. Algunas funciones empiezan con stat_nombre Función()

Primero, un gráfico con los datos:

ggplot(data = datos) + aes(x = Estrato, y = Peso) +
    geom_point(size = 3)
../../_images/output_92_03.png

Segundo, con el siguiente gráfico se calculará el promedio por cada Estrato.

Se utiliza la función stat_summary(), el promedio se especifica con fun = mean

ggplot(data = datos) + aes(x = Estrato, y = Peso) +
    stat_summary(fun = mean, geom = "point", color = "red", size = 3)
../../_images/output_94_01.png

El siguiente gráfico muestra los datos en color negro y el promedio por Estrato en color rojo.

ggplot(data = datos) + aes(x = Estrato, y = Peso) +
    geom_point(size = 3) +
    stat_summary(fun = "mean", geom = "point", color = "red", size = 3)
../../_images/output_96_02.png

El siguiente gráfico muestra los promedios por Estrato, pero en una línea roja.

ggplot(data = datos) + aes(x = Estrato, y = Peso) +
    geom_point(size = 3) +
    stat_summary(fun = "mean", geom = "line", color = "red", size = 1)
../../_images/output_98_01.png

Uso de los argumentos fun.min y fun.max:

Se muestra el promedio por Estrato, el máximo y el mínimo.

ggplot(data = datos) + aes(x = Estrato, y = Peso) +
    stat_summary(fun = mean, fun.min = min, fun.max = max, color = "red", size = 1)
../../_images/output_100_0.png

Proporciones:

Para mostrar proporciones, se agrega el siguiente argumento dentro de la función geom_bar():

y = ..prop..

Por defecto, el resultado que muestra es de conteo, y = ..count..

ggplot(data = datos) +
    geom_bar(aes(x = Estrato, y = ..prop..))
../../_images/output_103_0.png

Las demás funciones estadísticas también están por defecto en los gráficos.

Coordinates:

Se usa la función coord_flip para cambiar los ejes, es decir, girar el gráfico.

ggplot(data = datos) +
    geom_bar(aes(x = Estrato, y = ..prop..)) +
    coord_flip()
../../_images/output_107_0.png

Theme:

El siguiente gráfico tiene el tema por defecto que es el tema theme_gray.

Fondo gris y líneas de cuadrícula blancas, diseñado para presentar los datos y facilitar las comparaciones.

ggplot(data = datos) +
    geom_point(aes(x = Edad, y = Peso, color = Género), size = 5) +
    facet_wrap(~ Estrato)
../../_images/output_110_01.png

theme_bw:

Classic dark-on-light. Para usarse en proyectores.

ggplot(data = datos) +
    geom_point(aes(x = Edad, y = Peso, color = Género), size = 5) +
    facet_wrap(~ Estrato) +
    theme_bw()
../../_images/output_113_0.png

theme_linedraw:

Fondo blanco con líneas negras.

ggplot(data = datos) +
    geom_point(aes(x = Edad, y = Peso, color = Género), size = 5) +
    facet_wrap(~ Estrato) +
    theme_linedraw()
../../_images/output_116_01.png

theme_light:

Simular al anterior, theme_linedraw

ggplot(data = datos) +
    geom_point(aes(x = Edad, y = Peso, color = Género), size = 5) +
    facet_wrap(~ Estrato) +
    theme_light()
../../_images/output_119_0.png

theme_dark:

Similar al anterior, theme_light, pero con fondo oscuro. Ideal para resaltar líneas finas de color.

ggplot(data = datos) +
    geom_point(aes(x = Edad, y = Peso, color = Género), size = 5) +
    facet_wrap(~ Estrato) +
    theme_dark()
../../_images/output_122_0.png

theme_minimal:

ggplot(data = datos) +
    geom_point(aes(x = Edad, y = Peso, color = Género), size = 5) +
    facet_wrap(~ Estrato) +
    theme_minimal()
../../_images/output_124_0.png

theme_classic:

Sin líneas de cuadrícula.

ggplot(data = datos) +
    geom_point(aes(x = Edad, y = Peso, color = Género), size = 5) +
    facet_wrap(~ Estrato) +
    theme_classic()
../../_images/output_127_01.png

theme_void:

Vacío

ggplot(data = datos) +
    geom_point(aes(x = Edad, y = Peso, color = Género), size = 5) +
    facet_wrap(~ Estrato) +
    theme_void()
../../_images/output_130_0.png

theme_test:

ggplot(data = datos) +
    geom_point(aes(x = Edad, y = Peso, color = Género), size = 5) +
    facet_wrap(~ Estrato) +
    theme_test()
../../_images/output_132_0.png

Títulos y etiquetas:

Los títulos y las etiquetas se agregan con labs().

Argumentos de labs():

title - Título

subtitle - Subtítulo

caption - Viñeta

x - Nombre eje \(X\)

y - Nombre eje \(y\)

fill - Nombre de la leyenda de códigos de colores creados con fill =

color - Nombre de la leyenda de códigos de colores creados con color =

shape - Nombre de la leyenda de simbología creada con shape =

ggplot(data = datos) +
    geom_point(aes(x = Edad, y = Peso, color = Nombre, shape = Género), size = 4) +
    facet_wrap(~ Estrato) +
    theme_minimal() +
    labs(title = "Peso vs. Edad",
        subtitle = "Clasificación por Género, Estrato y Nombre",
        caption = "Fuente: Elaboración propia",
        x = "Edad",
        y = "Peso",
        shape = "Género con \n formas diferentes",  # Se personaliza la leyenda de Género
        color = "Cada nombre \n con un color")      # Se personaliza la leyenda de Nombre
../../_images/output_135_01.png

Extraer los gráficos:

Los gráficos se pueden extraer con la función ggsave("Nombre.extensión")

Por defecto extrae el último gráfico.

Formatos: “eps”, “ps”, “tex” (pictex), “pdf”, “jpeg”, “tiff”, “png”, “bmp”, “svg”

ggsave("Guardado.png")
Saving 6.67 x 6.67 in image